כתבות עם התגית AlphaFold

סקירה זו היא חלק מפינה קבועה בה אנו סוקרים מאמרים חשובים בתחום ה-ML/DL, וכותבים גרסה פשוטה וברורה יותר שלהם בעברית. במידה ותרצו לקרוא את המאמרים הנוספים שסיכמנו, אתם מוזמנים לבדוק את העמוד שמרכז אותם תחת השם deepnightlearners.


לילה טוב חברים, היום אנחנו שוב בפינתנו deepnightlearners עם סקירה של מאמר בתחום הלמידה העמוקה. היום נבחר לסקירה המאמר שנקרא:

Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold

פינת הסוקר:

המלצת קריאה מאופיר: קריאה מרתקת, במיוחד למי שמתעניין גם בביואינפורמטיקה. כמות המשאבים שהושקעו במחקר והתוצאות שלו מסחררות. מעבר לחידושים עבור הבעיה הספציפית, מוצגות טכניקות חדשות באופן כללי.

בהירות קריאה: בינונית-גבוהה.

רמת היכרות עם כלים מתמטיים וטכניקות של ML/DL הנדרשים להבנת המאמר: נדרשת היכרות עם למידה עמוקה. בנוסף, מומלצת מאוד היכרות עם מושגים ביואינפורמטיים.

יישומים פרקטיים אפשריים: מדובר בכלי החזק ביותר כיום לניבוי מבנה של חלבונים, והוא צפוי לשמש רבות לקידום מחקר החלבונים בעולם, בין אם למדע בסיסי ובין אם לתחומים כמו הנדסת חלבונים. בנוגע לשימושים מסחריים – DeepMind שחררה את המודל והמשקולות, אך השימוש במשקולות אסור לשימוש מסחרי.


פרטי מאמר:

לינק למאמר: זמין כאן 

לינק לקוד: זמין להורדה 

פורסם בתאריך: 15/07/2021

הוצג בכתב העת: Nature

תחומי מאמר:

  • ניבוי מבנה תלת מימדי של חלבונים.

כלים מתמטיים, טכניקות, מושגים וסימונים:

  • רשתות נוירונים גרפיות (GNNs).
  • Attention.
  • Skip-connections.

מבוא והסבר כללי על תחום המאמר: לכתבה המלאה >>

קוראי הניוזלטר האדוקים, בוודאי יודעים שאני מסכם מידי שבוע את כל הפוסטים החשובים ביותר שעלו בקבוצת פייסבוק של הקהילה. כל שבוע אני סורק את הקבוצה ומחפש אחר הדיונים המרתקים ביותר שהתקיימו ומרכז את כולם במקום אחד כדי שאתם תוכלו לוודא שלא פספסתם אף נושא חשוב שעלה באותו השבוע. לאחרונה קבלתי הרבה בקשות להעביר את הפורמט של הסיכום השבועי למקום שיהיה יותר קל לשתף אותו ולשלוח לחברים. לכן, אני אתחיל לכתוב גם כאן בבלוג את הסיכום השבועי. חשוב לי להדגיש שבכל מקרה אשלח את הסיכום השבועי כלינק מסודר בניוזלטר, ככה שלא הרבה הולך להשתנות.

דרך אגב, אם אתם רוצים לוודא שאתם לא מפספסים את הסיכום השבועי, פשוט תירשמו לניוזלטר וככה תוכלו להישאר מעודכנים תמיד. כל שישי בבוקר יחכה לכם בתיבת המייל ניוזלטר חדש עם מידע שחשוב שתכירו. עוד סיבה ממש טובה להירשם לניוזלטר היא שאני מעדכן שם מידי פעם על כל מיני יוזמות ושיתופי פעולה שאני עובד עליהם הרבה לפני שהם עולים לקבוצה (ככה אני יכול לבדוק את התגובות לפני 🙂 ). בקיצור אל תפספסו.

עוד הערה קטנה, הסיכום השבועי ימשיך להיות באנגלית כי ככה יותר קל לכתוב אותו בצורה רציפה ללא ערבוב של האנגלית והעברית. נתחיל?

לכתבה המלאה >>

X